Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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