Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYK1

TLR7, Toll-like receptor 7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,049 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR7Q9NYK1 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TLR7Q9NYK1 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TLR7Q9NYK1 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TLR7Q9NYK1 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TLR7Q9NYK1 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TLR7Q9NYK1 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TLR7Q9NYK1 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TLR7Q9NYK1 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TLR7Q9NYK1 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TLR7Q9NYK1 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TLR7Q9NYK1 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TLR7Q9NYK1 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms