Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW13

RBM28, RNA-binding protein 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM28Q9NW13 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RBM28Q9NW13 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBM28Q9NW13 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RBM28Q9NW13 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBM28Q9NW13 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBM28Q9NW13 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBM28Q9NW13 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBM28Q9NW13 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBM28Q9NW13 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBM28Q9NW13 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBM28Q9NW13 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBM28Q9NW13 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBM28Q9NW13 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RBM28Q9NW13 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBM28Q9NW13 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBM28Q9NW13 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBM28Q9NW13 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBM28Q9NW13 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBM28Q9NW13 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBM28Q9NW13 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBM28Q9NW13 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBM28Q9NW13 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBM28Q9NW13 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBM28Q9NW13 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBM28Q9NW13 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBM28Q9NW13 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBM28Q9NW13 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBM28Q9NW13 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBM28Q9NW13 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBM28Q9NW13 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBM28Q9NW13 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBM28Q9NW13 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RBM28Q9NW13 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RBM28Q9NW13 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBM28Q9NW13 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBM28Q9NW13 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBM28Q9NW13 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBM28Q9NW13 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBM28Q9NW13 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBM28Q9NW13 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBM28Q9NW13 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBM28Q9NW13 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RBM28Q9NW13 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBM28Q9NW13 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBM28Q9NW13 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RBM28Q9NW13 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBM28Q9NW13 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBM28Q9NW13 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBM28Q9NW13 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBM28Q9NW13 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RBM28Q9NW13 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBM28Q9NW13 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBM28Q9NW13 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBM28Q9NW13 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBM28Q9NW13 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBM28Q9NW13 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBM28Q9NW13 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBM28Q9NW13 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBM28Q9NW13 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBM28Q9NW13 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RBM28Q9NW13 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBM28Q9NW13 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RBM28Q9NW13 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBM28Q9NW13 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBM28Q9NW13 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBM28Q9NW13 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RBM28Q9NW13 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBM28Q9NW13 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBM28Q9NW13 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBM28Q9NW13 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBM28Q9NW13 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBM28Q9NW13 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBM28Q9NW13 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBM28Q9NW13 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBM28Q9NW13 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBM28Q9NW13 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBM28Q9NW13 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBM28Q9NW13 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBM28Q9NW13 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBM28Q9NW13 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBM28Q9NW13 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBM28Q9NW13 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RBM28Q9NW13 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBM28Q9NW13 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RBM28Q9NW13 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RBM28Q9NW13 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBM28Q9NW13 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBM28Q9NW13 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBM28Q9NW13 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBM28Q9NW13 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBM28Q9NW13 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBM28Q9NW13 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBM28Q9NW13 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBM28Q9NW13 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBM28Q9NW13 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBM28Q9NW13 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBM28Q9NW13 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBM28Q9NW13 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBM28Q9NW13 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBM28Q9NW13 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms