Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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TDP1Q9NUW8 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
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TDP1Q9NUW8 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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TDP1Q9NUW8 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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TDP1Q9NUW8 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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TDP1Q9NUW8 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
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