Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 AC090519.2-201ENST00000559034 655 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 AC004672.2-201ENST00000537181 574 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 AC108673.2-201ENST00000608909 565 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms