Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LTBP3Q9NS15 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
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