Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRZ9

HELLS, Lymphoid-specific helicase, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELLSQ9NRZ9 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 366.3 ms