Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRU3

CNNM1, Metal transporter CNNM1, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM1Q9NRU3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CNNM1Q9NRU3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CNNM1Q9NRU3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CNNM1Q9NRU3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNNM1Q9NRU3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNNM1Q9NRU3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms