Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP4

SDHAF3, Succinate dehydrogenase assembly factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF3Q9NRP4 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SDHAF3Q9NRP4 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SDHAF3Q9NRP4 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SDHAF3Q9NRP4 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms