Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ5

PAPOLB, Poly(A) polymerase beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAPOLBQ9NRJ5 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAPOLBQ9NRJ5 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAPOLBQ9NRJ5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAPOLBQ9NRJ5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PAPOLBQ9NRJ5 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAPOLBQ9NRJ5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAPOLBQ9NRJ5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAPOLBQ9NRJ5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAPOLBQ9NRJ5 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAPOLBQ9NRJ5 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAPOLBQ9NRJ5 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAPOLBQ9NRJ5 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAPOLBQ9NRJ5 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PAPOLBQ9NRJ5 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAPOLBQ9NRJ5 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAPOLBQ9NRJ5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PAPOLBQ9NRJ5 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAPOLBQ9NRJ5 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAPOLBQ9NRJ5 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAPOLBQ9NRJ5 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAPOLBQ9NRJ5 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAPOLBQ9NRJ5 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAPOLBQ9NRJ5 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAPOLBQ9NRJ5 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PAPOLBQ9NRJ5 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAPOLBQ9NRJ5 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAPOLBQ9NRJ5 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAPOLBQ9NRJ5 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PAPOLBQ9NRJ5 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAPOLBQ9NRJ5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAPOLBQ9NRJ5 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAPOLBQ9NRJ5 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PAPOLBQ9NRJ5 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAPOLBQ9NRJ5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAPOLBQ9NRJ5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAPOLBQ9NRJ5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PAPOLBQ9NRJ5 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAPOLBQ9NRJ5 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAPOLBQ9NRJ5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAPOLBQ9NRJ5 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAPOLBQ9NRJ5 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAPOLBQ9NRJ5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAPOLBQ9NRJ5 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAPOLBQ9NRJ5 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAPOLBQ9NRJ5 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAPOLBQ9NRJ5 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAPOLBQ9NRJ5 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PAPOLBQ9NRJ5 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms