Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZCCHC17Q9NP64 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms