Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ6

VAT1L, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1LQ9HCJ6 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms