Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBG7

LY9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY9Q9HBG7 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LY9Q9HBG7 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms