Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB31

SEBOX, Homeobox protein SEBOX, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEBOXQ9HB31 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms