Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB3

SLC52A2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A2Q9HAB3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC52A2Q9HAB3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC52A2Q9HAB3 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC52A2Q9HAB3 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SLC52A2Q9HAB3 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC52A2Q9HAB3 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC52A2Q9HAB3 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC52A2Q9HAB3 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC52A2Q9HAB3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC52A2Q9HAB3 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC52A2Q9HAB3 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC52A2Q9HAB3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC52A2Q9HAB3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC52A2Q9HAB3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC52A2Q9HAB3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC52A2Q9HAB3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC52A2Q9HAB3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC52A2Q9HAB3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC52A2Q9HAB3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC52A2Q9HAB3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC52A2Q9HAB3 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC52A2Q9HAB3 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC52A2Q9HAB3 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC52A2Q9HAB3 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC52A2Q9HAB3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC52A2Q9HAB3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC52A2Q9HAB3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC52A2Q9HAB3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC52A2Q9HAB3 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC52A2Q9HAB3 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC52A2Q9HAB3 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC52A2Q9HAB3 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC52A2Q9HAB3 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC52A2Q9HAB3 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC52A2Q9HAB3 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC52A2Q9HAB3 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC52A2Q9HAB3 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC52A2Q9HAB3 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC52A2Q9HAB3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC52A2Q9HAB3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC52A2Q9HAB3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC52A2Q9HAB3 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC52A2Q9HAB3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC52A2Q9HAB3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC52A2Q9HAB3 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC52A2Q9HAB3 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC52A2Q9HAB3 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC52A2Q9HAB3 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC52A2Q9HAB3 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC52A2Q9HAB3 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC52A2Q9HAB3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC52A2Q9HAB3 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC52A2Q9HAB3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC52A2Q9HAB3 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC52A2Q9HAB3 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC52A2Q9HAB3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC52A2Q9HAB3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC52A2Q9HAB3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC52A2Q9HAB3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC52A2Q9HAB3 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC52A2Q9HAB3 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC52A2Q9HAB3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC52A2Q9HAB3 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC52A2Q9HAB3 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC52A2Q9HAB3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC52A2Q9HAB3 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC52A2Q9HAB3 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC52A2Q9HAB3 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC52A2Q9HAB3 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC52A2Q9HAB3 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC52A2Q9HAB3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC52A2Q9HAB3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC52A2Q9HAB3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC52A2Q9HAB3 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC52A2Q9HAB3 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SLC52A2Q9HAB3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SLC52A2Q9HAB3 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SLC52A2Q9HAB3 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SLC52A2Q9HAB3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms