Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3S3

TMPRSS5, Transmembrane protease serine 5, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS5Q9H3S3 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS5Q9H3S3 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS5Q9H3S3 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS5Q9H3S3 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS5Q9H3S3 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS5Q9H3S3 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS5Q9H3S3 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS5Q9H3S3 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS5Q9H3S3 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS5Q9H3S3 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS5Q9H3S3 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS5Q9H3S3 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS5Q9H3S3 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS5Q9H3S3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS5Q9H3S3 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS5Q9H3S3 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS5Q9H3S3 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS5Q9H3S3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS5Q9H3S3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS5Q9H3S3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS5Q9H3S3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS5Q9H3S3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS5Q9H3S3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS5Q9H3S3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS5Q9H3S3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS5Q9H3S3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS5Q9H3S3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS5Q9H3S3 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS5Q9H3S3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS5Q9H3S3 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS5Q9H3S3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS5Q9H3S3 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS5Q9H3S3 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS5Q9H3S3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS5Q9H3S3 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS5Q9H3S3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS5Q9H3S3 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS5Q9H3S3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMPRSS5Q9H3S3 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMPRSS5Q9H3S3 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMPRSS5Q9H3S3 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMPRSS5Q9H3S3 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMPRSS5Q9H3S3 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMPRSS5Q9H3S3 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMPRSS5Q9H3S3 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMPRSS5Q9H3S3 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMPRSS5Q9H3S3 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMPRSS5Q9H3S3 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMPRSS5Q9H3S3 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMPRSS5Q9H3S3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMPRSS5Q9H3S3 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMPRSS5Q9H3S3 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMPRSS5Q9H3S3 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMPRSS5Q9H3S3 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMPRSS5Q9H3S3 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMPRSS5Q9H3S3 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMPRSS5Q9H3S3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMPRSS5Q9H3S3 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMPRSS5Q9H3S3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMPRSS5Q9H3S3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMPRSS5Q9H3S3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMPRSS5Q9H3S3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMPRSS5Q9H3S3 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMPRSS5Q9H3S3 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMPRSS5Q9H3S3 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMPRSS5Q9H3S3 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMPRSS5Q9H3S3 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMPRSS5Q9H3S3 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMPRSS5Q9H3S3 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMPRSS5Q9H3S3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMPRSS5Q9H3S3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMPRSS5Q9H3S3 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMPRSS5Q9H3S3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMPRSS5Q9H3S3 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMPRSS5Q9H3S3 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMPRSS5Q9H3S3 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMPRSS5Q9H3S3 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMPRSS5Q9H3S3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMPRSS5Q9H3S3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TMPRSS5Q9H3S3 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMPRSS5Q9H3S3 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMPRSS5Q9H3S3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMPRSS5Q9H3S3 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMPRSS5Q9H3S3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMPRSS5Q9H3S3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMPRSS5Q9H3S3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMPRSS5Q9H3S3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMPRSS5Q9H3S3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TMPRSS5Q9H3S3 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMPRSS5Q9H3S3 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMPRSS5Q9H3S3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMPRSS5Q9H3S3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMPRSS5Q9H3S3 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMPRSS5Q9H3S3 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMPRSS5Q9H3S3 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMPRSS5Q9H3S3 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMPRSS5Q9H3S3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
TMPRSS5Q9H3S3 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMPRSS5Q9H3S3 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMPRSS5Q9H3S3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms