Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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CTDSP1Q9GZU7 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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