Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I1

MTMR12, Myotubularin-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR12Q9C0I1 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MTMR12Q9C0I1 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MTMR12Q9C0I1 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MTMR12Q9C0I1 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MTMR12Q9C0I1 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MTMR12Q9C0I1 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MTMR12Q9C0I1 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MTMR12Q9C0I1 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MTMR12Q9C0I1 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MTMR12Q9C0I1 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MTMR12Q9C0I1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MTMR12Q9C0I1 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MTMR12Q9C0I1 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MTMR12Q9C0I1 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MTMR12Q9C0I1 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MTMR12Q9C0I1 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MTMR12Q9C0I1 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MTMR12Q9C0I1 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MTMR12Q9C0I1 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MTMR12Q9C0I1 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MTMR12Q9C0I1 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MTMR12Q9C0I1 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MTMR12Q9C0I1 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
MTMR12Q9C0I1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MTMR12Q9C0I1 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MTMR12Q9C0I1 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MTMR12Q9C0I1 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MTMR12Q9C0I1 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MTMR12Q9C0I1 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MTMR12Q9C0I1 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MTMR12Q9C0I1 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
MTMR12Q9C0I1 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MTMR12Q9C0I1 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MTMR12Q9C0I1 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MTMR12Q9C0I1 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MTMR12Q9C0I1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MTMR12Q9C0I1 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MTMR12Q9C0I1 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MTMR12Q9C0I1 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
MTMR12Q9C0I1 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
MTMR12Q9C0I1 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
MTMR12Q9C0I1 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
MTMR12Q9C0I1 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms