Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZI7

UPF3B, Regulator of nonsense transcripts 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF3BQ9BZI7 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UPF3BQ9BZI7 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
UPF3BQ9BZI7 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UPF3BQ9BZI7 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UPF3BQ9BZI7 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UPF3BQ9BZI7 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UPF3BQ9BZI7 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UPF3BQ9BZI7 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UPF3BQ9BZI7 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UPF3BQ9BZI7 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UPF3BQ9BZI7 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UPF3BQ9BZI7 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UPF3BQ9BZI7 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UPF3BQ9BZI7 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UPF3BQ9BZI7 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UPF3BQ9BZI7 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UPF3BQ9BZI7 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UPF3BQ9BZI7 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UPF3BQ9BZI7 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UPF3BQ9BZI7 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UPF3BQ9BZI7 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UPF3BQ9BZI7 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UPF3BQ9BZI7 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UPF3BQ9BZI7 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UPF3BQ9BZI7 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UPF3BQ9BZI7 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UPF3BQ9BZI7 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UPF3BQ9BZI7 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UPF3BQ9BZI7 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UPF3BQ9BZI7 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UPF3BQ9BZI7 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UPF3BQ9BZI7 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UPF3BQ9BZI7 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UPF3BQ9BZI7 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UPF3BQ9BZI7 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
UPF3BQ9BZI7 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UPF3BQ9BZI7 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UPF3BQ9BZI7 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UPF3BQ9BZI7 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UPF3BQ9BZI7 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UPF3BQ9BZI7 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UPF3BQ9BZI7 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UPF3BQ9BZI7 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UPF3BQ9BZI7 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UPF3BQ9BZI7 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UPF3BQ9BZI7 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UPF3BQ9BZI7 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UPF3BQ9BZI7 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UPF3BQ9BZI7 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UPF3BQ9BZI7 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UPF3BQ9BZI7 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms