Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM54Q9BYV2 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms