Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GSDMCQ9BYG8 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GSDMCQ9BYG8 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GSDMCQ9BYG8 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GSDMCQ9BYG8 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GSDMCQ9BYG8 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GSDMCQ9BYG8 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GSDMCQ9BYG8 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GSDMCQ9BYG8 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GSDMCQ9BYG8 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GSDMCQ9BYG8 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GSDMCQ9BYG8 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GSDMCQ9BYG8 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GSDMCQ9BYG8 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GSDMCQ9BYG8 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GSDMCQ9BYG8 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GSDMCQ9BYG8 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GSDMCQ9BYG8 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GSDMCQ9BYG8 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GSDMCQ9BYG8 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GSDMCQ9BYG8 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GSDMCQ9BYG8 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GSDMCQ9BYG8 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GSDMCQ9BYG8 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GSDMCQ9BYG8 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GSDMCQ9BYG8 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GSDMCQ9BYG8 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GSDMCQ9BYG8 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GSDMCQ9BYG8 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GSDMCQ9BYG8 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GSDMCQ9BYG8 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GSDMCQ9BYG8 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GSDMCQ9BYG8 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GSDMCQ9BYG8 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GSDMCQ9BYG8 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GSDMCQ9BYG8 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GSDMCQ9BYG8 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GSDMCQ9BYG8 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GSDMCQ9BYG8 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GSDMCQ9BYG8 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GSDMCQ9BYG8 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GSDMCQ9BYG8 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GSDMCQ9BYG8 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GSDMCQ9BYG8 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GSDMCQ9BYG8 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GSDMCQ9BYG8 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GSDMCQ9BYG8 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GSDMCQ9BYG8 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GSDMCQ9BYG8 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GSDMCQ9BYG8 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GSDMCQ9BYG8 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GSDMCQ9BYG8 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GSDMCQ9BYG8 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GSDMCQ9BYG8 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GSDMCQ9BYG8 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GSDMCQ9BYG8 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GSDMCQ9BYG8 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GSDMCQ9BYG8 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GSDMCQ9BYG8 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GSDMCQ9BYG8 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GSDMCQ9BYG8 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GSDMCQ9BYG8 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GSDMCQ9BYG8 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GSDMCQ9BYG8 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GSDMCQ9BYG8 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GSDMCQ9BYG8 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GSDMCQ9BYG8 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GSDMCQ9BYG8 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GSDMCQ9BYG8 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GSDMCQ9BYG8 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GSDMCQ9BYG8 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GSDMCQ9BYG8 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GSDMCQ9BYG8 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GSDMCQ9BYG8 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GSDMCQ9BYG8 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GSDMCQ9BYG8 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GSDMCQ9BYG8 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GSDMCQ9BYG8 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GSDMCQ9BYG8 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GSDMCQ9BYG8 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GSDMCQ9BYG8 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GSDMCQ9BYG8 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GSDMCQ9BYG8 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GSDMCQ9BYG8 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GSDMCQ9BYG8 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GSDMCQ9BYG8 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GSDMCQ9BYG8 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GSDMCQ9BYG8 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GSDMCQ9BYG8 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GSDMCQ9BYG8 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GSDMCQ9BYG8 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GSDMCQ9BYG8 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GSDMCQ9BYG8 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GSDMCQ9BYG8 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GSDMCQ9BYG8 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GSDMCQ9BYG8 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GSDMCQ9BYG8 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GSDMCQ9BYG8 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GSDMCQ9BYG8 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GSDMCQ9BYG8 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms