Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT76

UPK3B, Uroplakin-3b, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BQ9BT76 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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