Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TINF2Q9BSI4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TINF2Q9BSI4 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TINF2Q9BSI4 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TINF2Q9BSI4 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TINF2Q9BSI4 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TINF2Q9BSI4 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TINF2Q9BSI4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TINF2Q9BSI4 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TINF2Q9BSI4 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TINF2Q9BSI4 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TINF2Q9BSI4 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TINF2Q9BSI4 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TINF2Q9BSI4 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TINF2Q9BSI4 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TINF2Q9BSI4 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TINF2Q9BSI4 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TINF2Q9BSI4 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TINF2Q9BSI4 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TINF2Q9BSI4 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TINF2Q9BSI4 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TINF2Q9BSI4 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TINF2Q9BSI4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TINF2Q9BSI4 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TINF2Q9BSI4 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TINF2Q9BSI4 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TINF2Q9BSI4 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TINF2Q9BSI4 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TINF2Q9BSI4 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TINF2Q9BSI4 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TINF2Q9BSI4 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TINF2Q9BSI4 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TINF2Q9BSI4 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TINF2Q9BSI4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TINF2Q9BSI4 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TINF2Q9BSI4 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms