Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GINS3Q9BRX5 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms