Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms