Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms