Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms