Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LPIN3Q9BQK8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LPIN3Q9BQK8 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LPIN3Q9BQK8 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
LPIN3Q9BQK8 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LPIN3Q9BQK8 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LPIN3Q9BQK8 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LPIN3Q9BQK8 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LPIN3Q9BQK8 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LPIN3Q9BQK8 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LPIN3Q9BQK8 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LPIN3Q9BQK8 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LPIN3Q9BQK8 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LPIN3Q9BQK8 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LPIN3Q9BQK8 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LPIN3Q9BQK8 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LPIN3Q9BQK8 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LPIN3Q9BQK8 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LPIN3Q9BQK8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LPIN3Q9BQK8 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LPIN3Q9BQK8 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LPIN3Q9BQK8 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LPIN3Q9BQK8 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LPIN3Q9BQK8 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LPIN3Q9BQK8 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LPIN3Q9BQK8 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LPIN3Q9BQK8 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LPIN3Q9BQK8 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
LPIN3Q9BQK8 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LPIN3Q9BQK8 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LPIN3Q9BQK8 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LPIN3Q9BQK8 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LPIN3Q9BQK8 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LPIN3Q9BQK8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LPIN3Q9BQK8 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LPIN3Q9BQK8 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LPIN3Q9BQK8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LPIN3Q9BQK8 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
LPIN3Q9BQK8 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LPIN3Q9BQK8 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LPIN3Q9BQK8 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LPIN3Q9BQK8 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LPIN3Q9BQK8 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LPIN3Q9BQK8 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LPIN3Q9BQK8 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LPIN3Q9BQK8 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LPIN3Q9BQK8 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LPIN3Q9BQK8 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LPIN3Q9BQK8 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LPIN3Q9BQK8 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LPIN3Q9BQK8 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LPIN3Q9BQK8 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LPIN3Q9BQK8 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LPIN3Q9BQK8 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LPIN3Q9BQK8 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LPIN3Q9BQK8 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LPIN3Q9BQK8 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LPIN3Q9BQK8 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LPIN3Q9BQK8 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
LPIN3Q9BQK8 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LPIN3Q9BQK8 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LPIN3Q9BQK8 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LPIN3Q9BQK8 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LPIN3Q9BQK8 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LPIN3Q9BQK8 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LPIN3Q9BQK8 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LPIN3Q9BQK8 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LPIN3Q9BQK8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LPIN3Q9BQK8 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LPIN3Q9BQK8 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LPIN3Q9BQK8 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LPIN3Q9BQK8 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LPIN3Q9BQK8 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LPIN3Q9BQK8 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LPIN3Q9BQK8 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LPIN3Q9BQK8 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LPIN3Q9BQK8 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LPIN3Q9BQK8 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LPIN3Q9BQK8 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LPIN3Q9BQK8 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LPIN3Q9BQK8 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LPIN3Q9BQK8 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LPIN3Q9BQK8 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LPIN3Q9BQK8 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LPIN3Q9BQK8 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LPIN3Q9BQK8 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LPIN3Q9BQK8 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LPIN3Q9BQK8 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LPIN3Q9BQK8 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LPIN3Q9BQK8 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LPIN3Q9BQK8 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LPIN3Q9BQK8 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LPIN3Q9BQK8 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LPIN3Q9BQK8 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LPIN3Q9BQK8 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LPIN3Q9BQK8 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LPIN3Q9BQK8 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LPIN3Q9BQK8 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
LPIN3Q9BQK8 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LPIN3Q9BQK8 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms