Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLF1Q9BQI6 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms