Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBA1CQ9BQE3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBA1CQ9BQE3 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBA1CQ9BQE3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBA1CQ9BQE3 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBA1CQ9BQE3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBA1CQ9BQE3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBA1CQ9BQE3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBA1CQ9BQE3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBA1CQ9BQE3 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBA1CQ9BQE3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBA1CQ9BQE3 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBA1CQ9BQE3 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBA1CQ9BQE3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBA1CQ9BQE3 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBA1CQ9BQE3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBA1CQ9BQE3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBA1CQ9BQE3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBA1CQ9BQE3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBA1CQ9BQE3 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBA1CQ9BQE3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBA1CQ9BQE3 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBA1CQ9BQE3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms