Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms