Protein–RNA interactions for Protein: Q96S65

CSRNP1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1Q96S65 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSRNP1Q96S65 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CSRNP1Q96S65 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSRNP1Q96S65 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CSRNP1Q96S65 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSRNP1Q96S65 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSRNP1Q96S65 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSRNP1Q96S65 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSRNP1Q96S65 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSRNP1Q96S65 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSRNP1Q96S65 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSRNP1Q96S65 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSRNP1Q96S65 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSRNP1Q96S65 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSRNP1Q96S65 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CSRNP1Q96S65 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CSRNP1Q96S65 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSRNP1Q96S65 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CSRNP1Q96S65 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSRNP1Q96S65 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CSRNP1Q96S65 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CSRNP1Q96S65 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CSRNP1Q96S65 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSRNP1Q96S65 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CSRNP1Q96S65 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CSRNP1Q96S65 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSRNP1Q96S65 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSRNP1Q96S65 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSRNP1Q96S65 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSRNP1Q96S65 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSRNP1Q96S65 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSRNP1Q96S65 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSRNP1Q96S65 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSRNP1Q96S65 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSRNP1Q96S65 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSRNP1Q96S65 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSRNP1Q96S65 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSRNP1Q96S65 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSRNP1Q96S65 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSRNP1Q96S65 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSRNP1Q96S65 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSRNP1Q96S65 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSRNP1Q96S65 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSRNP1Q96S65 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSRNP1Q96S65 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSRNP1Q96S65 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSRNP1Q96S65 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSRNP1Q96S65 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSRNP1Q96S65 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSRNP1Q96S65 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CSRNP1Q96S65 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSRNP1Q96S65 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSRNP1Q96S65 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSRNP1Q96S65 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSRNP1Q96S65 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSRNP1Q96S65 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSRNP1Q96S65 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSRNP1Q96S65 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSRNP1Q96S65 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSRNP1Q96S65 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSRNP1Q96S65 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSRNP1Q96S65 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSRNP1Q96S65 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSRNP1Q96S65 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSRNP1Q96S65 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSRNP1Q96S65 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSRNP1Q96S65 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSRNP1Q96S65 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSRNP1Q96S65 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSRNP1Q96S65 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSRNP1Q96S65 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSRNP1Q96S65 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSRNP1Q96S65 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSRNP1Q96S65 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSRNP1Q96S65 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSRNP1Q96S65 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSRNP1Q96S65 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CSRNP1Q96S65 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CSRNP1Q96S65 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSRNP1Q96S65 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSRNP1Q96S65 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CSRNP1Q96S65 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSRNP1Q96S65 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CSRNP1Q96S65 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSRNP1Q96S65 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CSRNP1Q96S65 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSRNP1Q96S65 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSRNP1Q96S65 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSRNP1Q96S65 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSRNP1Q96S65 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSRNP1Q96S65 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSRNP1Q96S65 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSRNP1Q96S65 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSRNP1Q96S65 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CSRNP1Q96S65 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSRNP1Q96S65 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSRNP1Q96S65 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSRNP1Q96S65 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSRNP1Q96S65 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSRNP1Q96S65 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms