Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 AC020910.4-201ENST00000612269 540 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 AC027348.2-201ENST00000624375 642 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 AC022960.2-201ENST00000616300 666 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 AC068389.4-201ENST00000531379 689 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms