Protein–RNA interactions for Protein: Q96PT4

DUX3, Putative double homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX3Q96PT4 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DUX3Q96PT4 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DUX3Q96PT4 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUX3Q96PT4 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DUX3Q96PT4 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUX3Q96PT4 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DUX3Q96PT4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUX3Q96PT4 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUX3Q96PT4 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DUX3Q96PT4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DUX3Q96PT4 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUX3Q96PT4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUX3Q96PT4 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUX3Q96PT4 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DUX3Q96PT4 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DUX3Q96PT4 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DUX3Q96PT4 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUX3Q96PT4 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
DUX3Q96PT4 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DUX3Q96PT4 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DUX3Q96PT4 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DUX3Q96PT4 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUX3Q96PT4 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUX3Q96PT4 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DUX3Q96PT4 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUX3Q96PT4 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DUX3Q96PT4 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUX3Q96PT4 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUX3Q96PT4 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DUX3Q96PT4 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUX3Q96PT4 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DUX3Q96PT4 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DUX3Q96PT4 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DUX3Q96PT4 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUX3Q96PT4 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUX3Q96PT4 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DUX3Q96PT4 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DUX3Q96PT4 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUX3Q96PT4 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
DUX3Q96PT4 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUX3Q96PT4 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DUX3Q96PT4 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DUX3Q96PT4 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUX3Q96PT4 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUX3Q96PT4 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DUX3Q96PT4 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DUX3Q96PT4 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUX3Q96PT4 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUX3Q96PT4 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUX3Q96PT4 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUX3Q96PT4 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUX3Q96PT4 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUX3Q96PT4 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUX3Q96PT4 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DUX3Q96PT4 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
DUX3Q96PT4 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUX3Q96PT4 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUX3Q96PT4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DUX3Q96PT4 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DUX3Q96PT4 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUX3Q96PT4 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DUX3Q96PT4 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DUX3Q96PT4 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
DUX3Q96PT4 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DUX3Q96PT4 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DUX3Q96PT4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
DUX3Q96PT4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DUX3Q96PT4 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DUX3Q96PT4 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DUX3Q96PT4 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DUX3Q96PT4 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.05■□□□□ -0
DUX3Q96PT4 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
DUX3Q96PT4 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DUX3Q96PT4 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
DUX3Q96PT4 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.05■□□□□ -0
DUX3Q96PT4 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.05■□□□□ -0
DUX3Q96PT4 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DUX3Q96PT4 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DUX3Q96PT4 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DUX3Q96PT4 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DUX3Q96PT4 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DUX3Q96PT4 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DUX3Q96PT4 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DUX3Q96PT4 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DUX3Q96PT4 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DUX3Q96PT4 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DUX3Q96PT4 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DUX3Q96PT4 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DUX3Q96PT4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DUX3Q96PT4 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DUX3Q96PT4 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DUX3Q96PT4 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DUX3Q96PT4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DUX3Q96PT4 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DUX3Q96PT4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DUX3Q96PT4 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DUX3Q96PT4 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DUX3Q96PT4 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DUX3Q96PT4 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DUX3Q96PT4 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms