Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRRC1Q96M27 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRRC1Q96M27 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRRC1Q96M27 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRRC1Q96M27 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
PRRC1Q96M27 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRRC1Q96M27 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRRC1Q96M27 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRRC1Q96M27 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRRC1Q96M27 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRRC1Q96M27 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRRC1Q96M27 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRRC1Q96M27 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRRC1Q96M27 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PRRC1Q96M27 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRRC1Q96M27 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRRC1Q96M27 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRRC1Q96M27 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRRC1Q96M27 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRRC1Q96M27 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRRC1Q96M27 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRRC1Q96M27 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRRC1Q96M27 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRRC1Q96M27 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRRC1Q96M27 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRRC1Q96M27 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRRC1Q96M27 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRRC1Q96M27 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRRC1Q96M27 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRRC1Q96M27 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRRC1Q96M27 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRRC1Q96M27 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRRC1Q96M27 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRRC1Q96M27 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRRC1Q96M27 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRRC1Q96M27 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRRC1Q96M27 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRRC1Q96M27 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRRC1Q96M27 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRRC1Q96M27 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRRC1Q96M27 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRRC1Q96M27 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRRC1Q96M27 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRRC1Q96M27 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRRC1Q96M27 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRRC1Q96M27 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRRC1Q96M27 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRRC1Q96M27 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PRRC1Q96M27 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms