Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms