Protein–RNA interactions for Protein: Q96J66

ABCC11, ATP-binding cassette sub-family C member 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC11Q96J66 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ABCC11Q96J66 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ABCC11Q96J66 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ABCC11Q96J66 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ABCC11Q96J66 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
ABCC11Q96J66 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ABCC11Q96J66 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
ABCC11Q96J66 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ABCC11Q96J66 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ABCC11Q96J66 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ABCC11Q96J66 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ABCC11Q96J66 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ABCC11Q96J66 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ABCC11Q96J66 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ABCC11Q96J66 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ABCC11Q96J66 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ABCC11Q96J66 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ABCC11Q96J66 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ABCC11Q96J66 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ABCC11Q96J66 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ABCC11Q96J66 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ABCC11Q96J66 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ABCC11Q96J66 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ABCC11Q96J66 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ABCC11Q96J66 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ABCC11Q96J66 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ABCC11Q96J66 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ABCC11Q96J66 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ABCC11Q96J66 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ABCC11Q96J66 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ABCC11Q96J66 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ABCC11Q96J66 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ABCC11Q96J66 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ABCC11Q96J66 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ABCC11Q96J66 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ABCC11Q96J66 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ABCC11Q96J66 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ABCC11Q96J66 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ABCC11Q96J66 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ABCC11Q96J66 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ABCC11Q96J66 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ABCC11Q96J66 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ABCC11Q96J66 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ABCC11Q96J66 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ABCC11Q96J66 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ABCC11Q96J66 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ABCC11Q96J66 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ABCC11Q96J66 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ABCC11Q96J66 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ABCC11Q96J66 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ABCC11Q96J66 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ABCC11Q96J66 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ABCC11Q96J66 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ABCC11Q96J66 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ABCC11Q96J66 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ABCC11Q96J66 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ABCC11Q96J66 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ABCC11Q96J66 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ABCC11Q96J66 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ABCC11Q96J66 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ABCC11Q96J66 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ABCC11Q96J66 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ABCC11Q96J66 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ABCC11Q96J66 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ABCC11Q96J66 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ABCC11Q96J66 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ABCC11Q96J66 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ABCC11Q96J66 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ABCC11Q96J66 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ABCC11Q96J66 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ABCC11Q96J66 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ABCC11Q96J66 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ABCC11Q96J66 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ABCC11Q96J66 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ABCC11Q96J66 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ABCC11Q96J66 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ABCC11Q96J66 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ABCC11Q96J66 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ABCC11Q96J66 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ABCC11Q96J66 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ABCC11Q96J66 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ABCC11Q96J66 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ABCC11Q96J66 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ABCC11Q96J66 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ABCC11Q96J66 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ABCC11Q96J66 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ABCC11Q96J66 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ABCC11Q96J66 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ABCC11Q96J66 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ABCC11Q96J66 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ABCC11Q96J66 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ABCC11Q96J66 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ABCC11Q96J66 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ABCC11Q96J66 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ABCC11Q96J66 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
ABCC11Q96J66 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
ABCC11Q96J66 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ABCC11Q96J66 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ABCC11Q96J66 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ABCC11Q96J66 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms