Protein–RNA interactions for Protein: Q96IS3

RAX2, Retina and anterior neural fold homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAX2Q96IS3 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAX2Q96IS3 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAX2Q96IS3 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAX2Q96IS3 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAX2Q96IS3 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RAX2Q96IS3 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAX2Q96IS3 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAX2Q96IS3 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAX2Q96IS3 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAX2Q96IS3 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAX2Q96IS3 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAX2Q96IS3 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAX2Q96IS3 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RAX2Q96IS3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAX2Q96IS3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAX2Q96IS3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAX2Q96IS3 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAX2Q96IS3 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAX2Q96IS3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAX2Q96IS3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAX2Q96IS3 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAX2Q96IS3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms