Protein–RNA interactions for Protein: Q96FQ7

LINC00526, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00526, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00526Q96FQ7 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00526Q96FQ7 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms