Protein–RNA interactions for Protein: Q96FF9

CDCA5, Sororin, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA5Q96FF9 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDCA5Q96FF9 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDCA5Q96FF9 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDCA5Q96FF9 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDCA5Q96FF9 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDCA5Q96FF9 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDCA5Q96FF9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDCA5Q96FF9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDCA5Q96FF9 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDCA5Q96FF9 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDCA5Q96FF9 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA5Q96FF9 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA5Q96FF9 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA5Q96FF9 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA5Q96FF9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA5Q96FF9 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA5Q96FF9 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA5Q96FF9 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA5Q96FF9 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA5Q96FF9 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA5Q96FF9 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA5Q96FF9 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA5Q96FF9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA5Q96FF9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA5Q96FF9 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA5Q96FF9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA5Q96FF9 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA5Q96FF9 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDCA5Q96FF9 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDCA5Q96FF9 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDCA5Q96FF9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDCA5Q96FF9 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CDCA5Q96FF9 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDCA5Q96FF9 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDCA5Q96FF9 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CDCA5Q96FF9 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDCA5Q96FF9 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDCA5Q96FF9 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CDCA5Q96FF9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDCA5Q96FF9 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CDCA5Q96FF9 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDCA5Q96FF9 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDCA5Q96FF9 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDCA5Q96FF9 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDCA5Q96FF9 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDCA5Q96FF9 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CDCA5Q96FF9 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDCA5Q96FF9 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDCA5Q96FF9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDCA5Q96FF9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDCA5Q96FF9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDCA5Q96FF9 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDCA5Q96FF9 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDCA5Q96FF9 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CDCA5Q96FF9 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDCA5Q96FF9 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CDCA5Q96FF9 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDCA5Q96FF9 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDCA5Q96FF9 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDCA5Q96FF9 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDCA5Q96FF9 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDCA5Q96FF9 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CDCA5Q96FF9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDCA5Q96FF9 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDCA5Q96FF9 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDCA5Q96FF9 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDCA5Q96FF9 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDCA5Q96FF9 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDCA5Q96FF9 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDCA5Q96FF9 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CDCA5Q96FF9 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDCA5Q96FF9 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDCA5Q96FF9 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDCA5Q96FF9 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDCA5Q96FF9 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDCA5Q96FF9 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDCA5Q96FF9 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDCA5Q96FF9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA5Q96FF9 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA5Q96FF9 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA5Q96FF9 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA5Q96FF9 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA5Q96FF9 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA5Q96FF9 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA5Q96FF9 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA5Q96FF9 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA5Q96FF9 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA5Q96FF9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA5Q96FF9 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA5Q96FF9 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA5Q96FF9 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA5Q96FF9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA5Q96FF9 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA5Q96FF9 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA5Q96FF9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDCA5Q96FF9 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDCA5Q96FF9 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDCA5Q96FF9 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDCA5Q96FF9 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDCA5Q96FF9 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms