Protein–RNA interactions for Protein: Q96F86

EDC3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3Q96F86 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EDC3Q96F86 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms