Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM3

RPUSD4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase RPUSD4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD4Q96CM3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPUSD4Q96CM3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPUSD4Q96CM3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPUSD4Q96CM3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RPUSD4Q96CM3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPUSD4Q96CM3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RPUSD4Q96CM3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPUSD4Q96CM3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPUSD4Q96CM3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPUSD4Q96CM3 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPUSD4Q96CM3 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPUSD4Q96CM3 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPUSD4Q96CM3 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPUSD4Q96CM3 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPUSD4Q96CM3 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPUSD4Q96CM3 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPUSD4Q96CM3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPUSD4Q96CM3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPUSD4Q96CM3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPUSD4Q96CM3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPUSD4Q96CM3 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPUSD4Q96CM3 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPUSD4Q96CM3 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPUSD4Q96CM3 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPUSD4Q96CM3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPUSD4Q96CM3 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPUSD4Q96CM3 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPUSD4Q96CM3 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPUSD4Q96CM3 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPUSD4Q96CM3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPUSD4Q96CM3 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPUSD4Q96CM3 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPUSD4Q96CM3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPUSD4Q96CM3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RPUSD4Q96CM3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPUSD4Q96CM3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPUSD4Q96CM3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPUSD4Q96CM3 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPUSD4Q96CM3 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPUSD4Q96CM3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPUSD4Q96CM3 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPUSD4Q96CM3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPUSD4Q96CM3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPUSD4Q96CM3 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPUSD4Q96CM3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPUSD4Q96CM3 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPUSD4Q96CM3 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPUSD4Q96CM3 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPUSD4Q96CM3 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPUSD4Q96CM3 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPUSD4Q96CM3 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPUSD4Q96CM3 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPUSD4Q96CM3 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPUSD4Q96CM3 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPUSD4Q96CM3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPUSD4Q96CM3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPUSD4Q96CM3 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPUSD4Q96CM3 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPUSD4Q96CM3 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPUSD4Q96CM3 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPUSD4Q96CM3 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPUSD4Q96CM3 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPUSD4Q96CM3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPUSD4Q96CM3 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPUSD4Q96CM3 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPUSD4Q96CM3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPUSD4Q96CM3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPUSD4Q96CM3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPUSD4Q96CM3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPUSD4Q96CM3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPUSD4Q96CM3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPUSD4Q96CM3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPUSD4Q96CM3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPUSD4Q96CM3 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPUSD4Q96CM3 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPUSD4Q96CM3 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPUSD4Q96CM3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPUSD4Q96CM3 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPUSD4Q96CM3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPUSD4Q96CM3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPUSD4Q96CM3 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPUSD4Q96CM3 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPUSD4Q96CM3 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPUSD4Q96CM3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPUSD4Q96CM3 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPUSD4Q96CM3 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPUSD4Q96CM3 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPUSD4Q96CM3 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPUSD4Q96CM3 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPUSD4Q96CM3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPUSD4Q96CM3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPUSD4Q96CM3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPUSD4Q96CM3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPUSD4Q96CM3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPUSD4Q96CM3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPUSD4Q96CM3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RPUSD4Q96CM3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPUSD4Q96CM3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPUSD4Q96CM3 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPUSD4Q96CM3 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms