Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms