Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HLA-CQ95604 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms