Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAD50Q92878 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms