Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms