Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV19

SFT2D1, Vesicle transport protein SFT2A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1Q8WV19 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms