Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV16

DCAF4, DDB1- and CUL4-associated factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF4Q8WV16 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms