Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY2

RB1CC1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RB1CC1Q8TDY2 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
RB1CC1Q8TDY2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC37.24■■■■□ 3.55
RB1CC1Q8TDY2 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
RB1CC1Q8TDY2 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC37.24■■■■□ 3.55
RB1CC1Q8TDY2 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
RB1CC1Q8TDY2 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC37.24■■■■□ 3.55
RB1CC1Q8TDY2 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
RB1CC1Q8TDY2 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC37.23■■■■□ 3.55
RB1CC1Q8TDY2 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
RB1CC1Q8TDY2 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
RB1CC1Q8TDY2 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.23■■■■□ 3.55
RB1CC1Q8TDY2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
RB1CC1Q8TDY2 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
RB1CC1Q8TDY2 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
RB1CC1Q8TDY2 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
RB1CC1Q8TDY2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC37.23■■■■□ 3.55
RB1CC1Q8TDY2 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
RB1CC1Q8TDY2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
RB1CC1Q8TDY2 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
RB1CC1Q8TDY2 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
RB1CC1Q8TDY2 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
RB1CC1Q8TDY2 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC37.22■■■■□ 3.55
RB1CC1Q8TDY2 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
RB1CC1Q8TDY2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC37.22■■■■□ 3.55
RB1CC1Q8TDY2 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
RB1CC1Q8TDY2 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
RB1CC1Q8TDY2 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
RB1CC1Q8TDY2 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
RB1CC1Q8TDY2 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
RB1CC1Q8TDY2 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
RB1CC1Q8TDY2 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
RB1CC1Q8TDY2 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
RB1CC1Q8TDY2 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
RB1CC1Q8TDY2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
RB1CC1Q8TDY2 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
RB1CC1Q8TDY2 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
RB1CC1Q8TDY2 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
RB1CC1Q8TDY2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
RB1CC1Q8TDY2 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
RB1CC1Q8TDY2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC37.21■■■■□ 3.55
RB1CC1Q8TDY2 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
RB1CC1Q8TDY2 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
RB1CC1Q8TDY2 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
RB1CC1Q8TDY2 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
RB1CC1Q8TDY2 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
RB1CC1Q8TDY2 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
RB1CC1Q8TDY2 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
RB1CC1Q8TDY2 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
RB1CC1Q8TDY2 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
RB1CC1Q8TDY2 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
RB1CC1Q8TDY2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
RB1CC1Q8TDY2 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC37.2■■■■□ 3.55
RB1CC1Q8TDY2 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.55
RB1CC1Q8TDY2 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
RB1CC1Q8TDY2 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
RB1CC1Q8TDY2 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
RB1CC1Q8TDY2 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
RB1CC1Q8TDY2 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.54
RB1CC1Q8TDY2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.54
RB1CC1Q8TDY2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
RB1CC1Q8TDY2 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
RB1CC1Q8TDY2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
RB1CC1Q8TDY2 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
RB1CC1Q8TDY2 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
RB1CC1Q8TDY2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
RB1CC1Q8TDY2 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
RB1CC1Q8TDY2 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC37.19■■■■□ 3.54
RB1CC1Q8TDY2 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
RB1CC1Q8TDY2 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC37.19■■■■□ 3.54
RB1CC1Q8TDY2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
RB1CC1Q8TDY2 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
RB1CC1Q8TDY2 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
RB1CC1Q8TDY2 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
RB1CC1Q8TDY2 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
RB1CC1Q8TDY2 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
RB1CC1Q8TDY2 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
RB1CC1Q8TDY2 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
RB1CC1Q8TDY2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
RB1CC1Q8TDY2 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC37.18■■■■□ 3.54
RB1CC1Q8TDY2 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
RB1CC1Q8TDY2 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
RB1CC1Q8TDY2 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
RB1CC1Q8TDY2 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
RB1CC1Q8TDY2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
RB1CC1Q8TDY2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
RB1CC1Q8TDY2 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
RB1CC1Q8TDY2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
RB1CC1Q8TDY2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
RB1CC1Q8TDY2 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC37.18■■■■□ 3.54
RB1CC1Q8TDY2 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
RB1CC1Q8TDY2 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
RB1CC1Q8TDY2 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC37.17■■■■□ 3.54
RB1CC1Q8TDY2 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
RB1CC1Q8TDY2 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
RB1CC1Q8TDY2 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
RB1CC1Q8TDY2 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
RB1CC1Q8TDY2 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC37.17■■■■□ 3.54
RB1CC1Q8TDY2 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.17■■■■□ 3.54
RB1CC1Q8TDY2 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
RB1CC1Q8TDY2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms