Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBB5

KLHDC4, Kelch domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC4Q8TBB5 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
KLHDC4Q8TBB5 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHDC4Q8TBB5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms